生信工程师经常和各种类型的数据打交道，除了很多软件外，我们还需要自己编写脚本来完成数据的个性化分析任务。常用的语言包括R， Perl以及Python。他们各有优点，但是julia作为后浪一点不输三者，甚至于在某些方面有独特之处。
鉴于目前julia尚处于发展阶段文档不全，包不好找，在这里推荐一些生信相关的包，方便大家寻找。
BioSequences.jl
这是一个生物序列相关的包，提供了用于生物序列（包括DNA，RNA和氨基酸序列）的常见操作的数据类型和方法，类型指的是将A/G/C/T/N/U等碱基或者其组合成的文本优化为类似矩阵的数据结构(eg. LongDNAseq)，即方便我们才用不同的方法操作(反向互补，切片，计数，突变等等)序列，也提供了更好的性能
FASTX.jl
提供了针对Fasta和Fastq序列文件的IO操作，可以直接将序列存储为BioSequence结构，方面文件交互。
注意： 你或许在用python的时候使用过pyfaidx随机提取基因组序列，虽然FASTX可以做到同样的事情，但是目前来说效率很低
BioAlignments.jl
NGS数据就离不开序列比对，无论是生物进化，序列注释还是Crispr基因编辑计数，都需要对大量序列做序列比对分析，该库提供了非常好用的算法和数据结构，可以执行局部比对或者全局比对，甚至于BWT算法的BAM文件的cigr字符也可以解析，可以在脱离htslib的情况下分析sam文件
GenomicFeatures.jl
经常用bedtools做基因区间分析，不妨来试试这个包，它既有bedtool的速度，又更加的灵活
BED.jl
解析bed文件
GFF3.jl
解析GFF和GTF的基因组注释文件
DataFrames.jl
类似于R的tibble和pandas的dataframe，表格分析的好帮手。转录组或基因芯片表达矩阵的分析的好帮手。单细胞矩阵分析重点参考base中的稀疏矩阵，有大用处。