根据UniprotID获取PDB结构并去冗余

用Julia的BioStructures包实现了一个根据UniprotID直接获取PDB结构的工具,同时还可以依据序列区间去冗余,代码放到了 GitHub - Wang-Lin-boop/GetPDB: Download pdb/protein structures from Uniprot id; This script will download related PDB files, extract chains(Optional), remove duplicates(Optional, maybe lost some conformation changed structures) and save as "UniprotID-PDBID-ModelID-ChainID.pdb/cif".
请各位大佬多多指教~

2 个赞

你这是把julia脚本嵌在bash里了么……
感觉你需要Roger写的那个工具……

啊 哪个工具?我是用Bash写了个Julia脚本,因为搞了好几个小时没搞明白PackageCompiler怎么用于是放弃了 :rofl:

厉害了大佬!我顶

应该就是这个 Comonicon.jl

哈哈 多谢 我还用了Linux的一些功能 wget awk之类的,不过,如果能全用julia实现也是个不错的想法 :grinning: